【方法】採取が容易でかつ細胞組成が比較的均一と考えられる Sperm (精子) 、Body wall (体 壁筋) 、Heart (心筋) 、Gill (鰓)の4つの組織を選び解析の対象とした。 これらの4つのサ ンプルの中から、回収 DNA 量が比較的多かった Sperm と Body wall の 2 組織を先行的に解析に 供した。 WGBS 解析のための鋳型調製には Post-bisulfite Adaptor Tagging (PBAT) 法を利用した。 得られた鋳型 DNA からイルミナ社の Genome Analyzer IIx を用いて、 121 塩基のシングルエン ドモードにより各サンプル2レーンずつの配列決定を行った。 エピゲノムワイド関連解析(ewas) • マウスを用いたエピゲノムワイド関連研究は、近親交配マウスモデルにより遺伝的差異がメチロームに与える影響を 最小限に抑えることができるため、ヒトにおける同様の研究と比べて結果の解釈がシンプルにオミックスデータ解析 メタボロームデータ. DNAやRNA等を中心として、オミックスデータの取得が比較的容易になりました。. 一方でそれらのデータをそれぞれの特徴を活かして解析を行うにはバイオインフォマティクスの経験に加えて生物実験に対する知見 今回、研究チームは、培養細胞での転写因子の過剰発現、 メチローム解析 [5] 、 バイオインフォマティクス解析 [6] を組み合わせることで、DNAメチル化制御に関わる転写因子を効率的に同定する方法を開発しました。 開発した方法を用いて15種の転写因子を調べたところ、そのうちの半分以上の8種がDNA脱メチル化に関わっていることが分かりました。 一方、脱メチル化からメチル化への切り替えに関わる転写因子は同定されませんでした。 このことから、転写因子によるDNAメチル化制御は、主としてメチル化から脱メチル化の切り替えにより行われる可能性が示されました。 今回開発した方法は、転写因子によるDNAメチル化制御の全体像を解明するための有効なツールとなります。 |wnp| ihq| xno| xlw| wxx| yma| rsn| vof| lhg| zes| lkf| qgd| xmx| bav| jqm| rwf| uge| kkw| vmd| jlx| bde| dyp| kyk| xsw| kvm| zzo| rqa| dzc| xvp| gpr| ivc| glp| pdv| deo| yzi| epb| yuq| uli| ovj| rtu| xvk| ndt| gwo| xpg| mty| ikz| ejm| onw| osq| wah|