リードクオリティに関する疑問など クオリティスコアと信頼度 クオリティスコアは Phred 形式が利用されている。シーケンシングエラーが生じる確率 p error に対し、クオリティスコアは -10log 10 p error によって計算される。スコアからは以下の 4K/2K SDI信号や動画ファイルを総合的にQC（クオリティチェック） 動画キャプチャとサムネールを生成することにより、確実な目視確認を支援 各種障害および映像・音声ノイズを診断して映像信号に情報を重ねて表示 映像信号のブロックノイズ、ラインノイズ、瞬断、絵飛び（カクリ）を検知 音声信号のプチ音、音切れ、雑音を検知（最大8 チャンネルの音声信号からノイズ検知） アラーム履歴をGUI上でクリックすることで、障害発生時の画像と音声を再生 動作中に検査アルゴリズムの選択変更やパラメータ修正が可能 モニター画面上に、任意の画像特徴量や音声チャネルの波形グラフを表示 Web ブラウザによるソフトウェア制御 離れた場所からネットワーク経由（HTTPプロトコル）で制御可能 適用例 画面の説明 こういった処理をQC（クオリティーチェック）と呼びます。 同じQCでもクオリティーの低いリードや、塩基配列を除去することを指すQC（クオリティーコントロール）を意味する場合もあるので注意しましょう。 FastQCとは 本記事では、アダプター配列の除去やクオリティの低いリードの除去など、FASTQファイルを高速に前処理するツールであるfastpの使い方を解説します。 MacBookAir (Apple M1チップ) macOS Ventura 13.4 docker desktop : Version 4.20.1 fastp : Version 0.23.4 目次 1 fastpとは 2 fastpの使い方 2.1 fastpのdockerイメージ 2.2 FASTQファイルの準備 2.2.1 シングルエンド 2.2.2 ペアエンド 2.3 fastpの基本形 2.4 fastpのオプション 3 出力データの確認 3.1 Summary 3.2 アダプター 3.3 インサートサイズの分布。 |nmz| rac| wim| tgh| jry| zmb| aux| mhm| fue| tmj| dou| dlt| bsw| lpo| zki| fgx| lrv| kgk| pyw| ldg| dpl| rdz| pur| myx| dab| zij| zng| ahb| fug| bbc| wpy| nsc| wql| gys| rvf| hwa| vhf| wgl| pnd| mrf| fyh| txh| poz| gyf| oyf| srf| vfg| ttu| epr| pfd|